La Farinera s’aixeca sobre l’antic molí del mig, un dels tres molins fariners que hi havia a la vila medieval de Castelló d’Empúries. El seu aspecte actual, notable edifici de tres plantes, i la maquinària que alberga són el resultat del procés d’industrialització, que al voltant de 1860 suposà la transformació tècnica i constructora de l'antic molí, esdevenint una fàbrica, que renovarà una part de la maquinària 90 anys desprès.